发行主体不同。股票由股份有限公司发行，非股份公司不能发行股票的；基金由投资基金公司发行，不一定是股份有限公司，且规定投资基金公司的是非银行金融机构，并且在其发起人中必须有一家金融机构。
分类不同。股票分普通股、优先股和后配股；基金分股票基金、债券基金、货币基金、混合基金等。
投资范围不同。股票只能是股票，而基金除了能买股票，又可以买债券等其他金融产品。
成交时间不同。大多数股票交易时间是周一至周五上午9:30至11:30和下午13:00至15:00两个时段。上午9:15开始，投资人就可以下单，委托价格限于前一个营业日收盘价的加减百分之十，即在当日的涨跌停板之间。9:25前委托的单子，在上午9:25时撮合，得出的价格便是所谓“开盘价”。9:25到9:30之间委托的单子,在9:30才开始处理。如果你委托的价格无法在当个交易日成交的话，隔一个交易日则必须重新挂单。休息日：周六、周日和上证所公告的休市日不交易。
而基金是按净值计算，会有认购费和赎回费，一般赎回时，资金不能立马到账。
风险系数不。股票的直接收益取决于发行公司的经营效益，不确定性强，投资于股票有较大的风险；基金主要投资于有价证券，投资选择灵活多样，从而使基金的收益有可能高于债券，投资风险相对小于股票。而股票基金投资的是股票组合，相对可起到分散风险的作用；所以相对来说买入一堆股票，也相当于基金，不过所选的股票组合和仓位管理可能就不如基金经理的专业。相对来说个股风险比基金大，个股踩雷会影响到很大的净值。但一个基金踩到个股的雷也最多不过占基金份额1-2%，影响不会很大。
流通性不同。封闭式基金类似于股票，大部分都在股市上流通，价格也随股市行情在波动。而开放式基金随时可在基金公司的柜台买进卖出。总的来说基金流动性比股票强。