下辖：
2个市辖区：牡丹区、定陶区
7个县：曹县、单县、成武县、巨野县、 郓城县、鄄城县、东明县
2个管理/高新/经济区：菏泽经济技术开发区、菏泽高新技术产业开发区
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定陶区：
1. 仿山旅游区（3A）
2. 法源寺（2A）
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牡丹区：
3. 曹州牡丹园（4A）
4. 菏泽市博物馆
5. 天香公园
6. 中国牡丹园（3A）
7. 冀鲁豫边区革命纪念馆（3A）
8. 古今牡丹园（2A）
9. 百花园（2A）
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曹县：
10. 曹县黄河故道国家湿地公园（2A）
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成武县：
11. 周自齐公园（2A）
12. 好客酒文化博览园（2A）
13. 文亭湖风景区（2A）
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单县
14. 浮龙湖生态旅游区（4A）：老子文化生态园（2A）
15. 单县牌坊古城景区（3A）
16. 幵山景区（3A）
17. 湖西革命烈士陵园（3A）
18. 单县科技馆（3A）
19. 荷园景区（2A）
20. 戴月公园（2A）
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东明县：
21. 东明黄河国家湿地公园（2A）
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巨野县：
22. 金山公园（2A）
23. 巨野县书画院（2A）
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鄄城县：
24. 东山禅寺（3A）
25. 孙膑旅游城：亿城寺（4A）
26. 沙土庙（3A）
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郓城县：
27. 水浒好汉城（4A）
28. 宋江湖（3A）
29. 唐塔广场（2A）