在宇宙的【方舟】中，平时是不会有驻守的兽化兵的，此时惊叹【方舟】庞大的几人是随着【兽神将——卡路雷欧】的直属部下。而【卡路雷欧】之所以来到【方舟】正是奉了【巴卡斯】的命令，要将已阵亡的三位【兽神将】的【水晶体】安置在此。在失去了【亚利桑纳总部基地】与【云界之门】后，似乎地球上再也没有绝对万无一失的地方了。并且【卡布拉尔】的【水晶体】也消失不见了。在准备好新的【兽神将】人选之前，【水晶体】绝对不能再出任何问题了！
但让【巴卡斯】绝对没想到的是，名为【深渊】的【阿波尔昂】此刻已经轻松地入侵了【方舟】之中，他的目标不仅是三个失去主人的【水晶体】，也包括了【卡路雷欧】体内的【水晶体】……