关联交易是指公司与关联自然人（董监高、实控人及其亲属）、关联法人（董监高、实控人及其亲属控制的法人机构）之间发生的交易，交易之前需要判断是否必须发生、交易价格是否公允、是否通过审议程序等，这是内部控制的规范要求，如果交易价格不公允、没有经过审议程序就产生了交易，这就构成了关联交易违规，会受到交易所的自律监管警示等处罚，严重的还会被证监会行政处罚、记入证券监管诚信档案。所以，公司在日常经营中尽可能避免发生关联交易，如果必须要发生关联交易，就要按照要求商定公允的交易价格、履行三会审议程序及信息披露工作，有独立董事的公司还需要独立董事发表意见。
上市公司在处理关联交易事项时是越来越规范，不过也难免处理不当，实例当中每年还是有不少因此被处罚的情况，原因在于公司管理层不认为是关联交易（判断有误，需要补充审议程序及信息披露工作），可能被交易所出具自律监管函；还有的是因为公司执行部门直接进行了交易，时候管理层才知道，这就说明内部控制出现了问题，审批流程管理不规范，内部信息沟通不顺畅，管理层没有尽到应尽的职责，这种情况一般会受到交易所的警示函，严重的还会被处以罚款。
拟上市公司发生关联交易的情况就更多了，一是监管不到，二是公司缺乏内部控制的制度，三是管理层能力受限（不需要信息披露、不被监管的情况下可能就不注重自身能力的提高），四是实控人独裁（本身还是意识问题）。有上市计划的公司老板还是有必要聘请专业的高级管理人才（董秘或者财总）进行规范。
新三板挂盘公司在关联交易控制方面也存在不少问题，从已经披露的信息来看，基本上所有的计划提交上市的公司都补充披露了关联交易事项，可见新三板挂牌公司的内部控制还是执行不到位，各项管理制度制定后可能就束之高阁了。