历史莫卧儿帝国的全盛时期，领土几乎囊括整个南亚次大陆以及阿富汗等地。
莫卧儿帝国上层建筑是穆斯林，而基础则是印度教，
波斯语是宫廷、公众事务、外交、文学和上流社会的语言。
莫卧儿帝国衰落后，大英帝国、法兰西殖民帝国、荷兰殖民帝国和葡萄牙殖民帝国等殖民帝国在印度争夺殖民地，最终英国胜利，使莫卧儿皇帝成为傀儡。
1858年，英国的维多利亚女王被授予印度女皇称号，成立英属印度，莫卧儿王朝灭亡。
建立帝国
帖木儿帝国灭亡后，巴布尔自从被驱逐河中之后，翻山越岭进入阿富汗，夺取喀布尔，在喀布尔建立了一个小王朝，
他率领伊斯迈尔借给他的军队匆忙赶回河中，胜利地进入了撒马尔罕城（1511年10月）。
继撒马尔罕之后，布哈拉又向他敞开了大门，而蒙古乌兹别克人退到塔什干。
巴布尔又去占领塔什干，成为塔什干和中亚的统治者。
以伊朗人在呼罗珊的胜利为支柱，帖木儿王朝在河中的复辟似乎是完成了。
巴布尔开始碰到了意想不到的困难。他曾求助过的、并接受其宗主权的波斯人是十叶派穆斯林。
布哈拉和撒马尔罕居民信奉的是逊尼派，他们斥责他与异端邪说者谈判，并与他断绝关系，他们的宗教热情比他们对帖木儿朝诸王的忠诚更加强烈。
由于受到这些宗教骚乱的鼓动，乌兹别克人又卷土重来。
巴布尔放弃了对河中的所有企图，退回到他的喀布尔王国，七年以后，他从喀布尔出发，前往征服印度。
布哈拉、撒马尔罕和整个河中地区又转到蒙古乌兹别克人手中。
巴布尔受挫后就把目光投向南方人心涣散、四分五裂的德里苏丹国。
恰在这时巴布尔有了一个方便的借口：旁遮普省总督邀请他出兵把他从其领主苏丹的手中“解救”出来。于是，他向南方进行了“圣战”。
印度的德里苏丹国遭受严重的打击，北部印度陷于分裂状态。
1510年时，蒙古贵族巴布尔就已经统治着印度北部。
1525年，巴布尔南下进攻印度，次年攻占德里，屡败印度诸侯联军，征服北印度大部分地区，建立莫卧儿帝国。
可见莫卧儿帝国最初是外族在印度建立的政权。
从此，印度的不同教派，分散的村社走上了民族统一的道路，成为当时世界上最富有、最强大的国家之一。
巴布尔占领了大半个印度半岛。
采用“以印治印”的手法，把印度半岛北部尚未征服的地盘划分给每一个印度的封建主，不管他们采用什么方法，只要管理那就是他们的领地。
不久，印度北部就基本统一了。1527年春天，巴布尔与拉那·桑伽两军交火。拉斯普特人最终还是被巴布尔打败了。
1528年，马茂德召集10万阿富汗联军于比哈尔，准备与巴布尔争一雌雄。
在恒河与哥桥拉河交汇处，两军摆开战场。巴布尔亲自指挥蒙古人在强大炮火掩护下强渡哥桥拉河，分兵夹击敌军。
两军相遇勇者胜，阿富汗人全线崩溃，马茂德逃亡孟加拉。这一仗成了巴布尔一生中征战之绝笔。
1530年12月26日，巴布尔英年早逝，年仅48岁。著有《巴布尔回忆录》。巴布尔在一生的征战中，占领了东起哥桥拉河，西至阿姆河，南起瓜廖尔，北至喜马拉雅山脉的大片领土。
中断与改制
1530年，巴布尔因病去世后，其子胡马雍继承皇位。
企图以察合台的突厥人、蒙古人、波斯人、阿富汗人和印度人组成的混合军队，征服全印度，以实现父亲的遗愿。
其三位异母兄弟卡姆兰、欣达勒和阿斯卡里出兵攻击他，与他争夺王位。
分散在各地的许多阿富汗贵族纷纷起兵反叛。
1539年，起兵谋反的东部阿富汗王公舍尔沙，在乔沙战役中胡马雍全军覆没，本人逃走。
舍尔沙占领德里，建立了苏尔王朝。
不但把领土扩展到孟加拉、比哈尔和马拉佤邦，而且在政治、社会和经济上多有建树。
他实行开明政治，对印度教采取宽容政策；它建立了有效力的君主集权制，执法公正；他改革税制，计田优劣征收，发行银卢比；兴修道路，设立驿站，联系首都阿拉格与孟加拉、拉齐普坦等地的“大干道”当代仍是印度的主要干道之一。
他的田赋改革是以后阿克巴改革的蓝本。
1545年舍尔沙在战争中被炸死。
1555年，胡马雍重征印度平原，占领德里和阿格拉，恢复了莫卧儿帝国在印度的统治。
在流亡伊朗期间，他进一步受到伊朗文化的影响，由逊尼派信徒改奉什叶派，并带回了对莫卧儿帝国有深远影响的伊朗文化。
在伊朗的帮助下，1556年，阿克巴继位，实行了进步的内政改革，采取宽容的宗教政策，扩大了莫卧儿帝国统治印度的社会、政治基础。
他建立中央集权制，开疆拓土，统一了次大陆广大地区，推动了印度社会经济的向前发展。将全国划分为若干伊克塔（省），下设47个萨卡尔（行政区），萨卡尔又划分为帕尔加纳，各设阿明（法官）、希克达尔（税务官）、司库、文书等地方官吏。
为了防止任何腐败行为，规定按时向官员支付薪俸，官员每隔2～3年调动一次。
但是之后不久自图书馆失足而死。
国势日盛
1556年，胡马雍重登帝位六个月后逝世。2月，在巴伊拉姆汗的帮助下，年仅十三岁的阿克巴继承了帝位。
阿克巴幼时未受到良好的教育，他在将军巴伊拉姆汗的辅佐下，开始治理莫卧儿帝国。
他刚继位时，莫卧儿帝国的领土很小，首都德里被阿富汗贵族希姆占领。希姆聚集起十万军队想一举消灭莫卧儿人。
而阿克巴的军队总共只有两万人。一些大臣劝阿克巴退出印度，回喀布尔休养生息。
但巴伊拉姆汗将军力排众议，提议调动一切力量与希姆决战。阿克巴采纳了这建议。决战的地点，是德里以北的帕尼帕特，三十年前阿克巴的祖父巴布尔取得重大胜利的地方。
阿克巴18岁时，他夺回大权，命令他的舅父到圣地麦加退隐。阿克巴终于自己独力执政了。
阿克巴摆脱左右羁绊后，便开始扩张领土的征讨，他对不同的地区采用不同的政策。对表示愿意归顺的地区，他仍让原来的头领管理土地，并对他的子孙委以重任。
1567年，阿克巴攻打梅瓦尔，用了4个月的时间攻下，屠杀了3万人，并把作为王国象征的大铜鼓和母神座上的大烛台拆下，当做自己的战利品。
阿克巴用武力和怀柔的手段，15年的时间里统一了北印度。
他又用16年时间把版图扩大到遥远的西北地方。
最后，他又用了3年的时间，平定了南方的几个王国，从而建立了一个强大的莫卧儿帝国。
为了巩固自己的政权，他对自己国家的内务进行改革整顿。
他命令官员重新丈量土地，将帝国分为182个税区，严格分别等级征税；他还废除将战俘卖为奴隶的习俗；下令取消人头税、香客税（对朝圣的印度教徒征服的税）、田赋附加税，遇到天灾人祸，则一律免交田赋；阿克巴统一了全国度量衡，有力地促进了工商业的发展。
阿克巴信仰伊斯兰教，而印度长期流行的是印度教，因此印度教和伊斯兰教之间经常发生矛盾冲突，这极大地影响了国家的安定团结。
为了协调印度教和伊斯兰教教徒们的关系，阿克巴采取了一系列的措施，他宣布各教派平等，他选用印度教人士做高级官员。
阿克巴自己还在宫庭中采纳印度教惯例。阿克巴出于自己“宽容大度的个性”和自己“对宗教思想的追求”，他还创立了一个没有上帝、没有先知、没有教务的“圣教”。
1605年10月，阿克巴去世。他去世后，他的后代统治印度的五十多年（1605—1657年）是莫卧儿帝国兴盛、封建经济发展的时期。
阿克巴为莫卧儿帝国的繁荣发展打下坚实的基础，他是莫卧儿帝国功勋显赫的最著名的人物之一。
鼎盛时期
阿克巴去世后，莫卧儿帝国先后由贾汉吉尔和沙贾汗统治。
贾汗吉国王（1605—1627年在位）时期，锡克教第五代祖师阿尔琼把教区改为行政机构，向信徒征收赋税。
这一举动在莫卧儿帝国内引起震动，它显然具有分庭抗礼的意味。
阿尔琼还在阿姆利则建立金店，作为锡克教圣地和行政管理中心。
锡克教圣典《阿底格兰特》也成书于这个时期。锡克教过去一直标榜为和平静修的团体，祖师只关心传教，从不干预政治。
阿尔琼却卷入了莫卧儿皇室的纷争，庇护叛乱的王子，从而遭到贾汗吉国王的嫉恨，1606年引来杀身之祸。
以此为发端，锡克教和平发展时期结束。
1633年，沙贾汗击败并兼并了艾哈迈德讷格尔王国。然而，这次胜利却激起几股力量的反抗，这些力量将加速莫卧儿帝国的灭亡。
沙贾汗于1638年重新占领坎大哈，但于1649年再次失去了它。在一次徒劳无功的攻占撒马尔罕的尝试中，他损失了5000人。
他只在南方取得了胜利，在那里，他首先追击一位因被怀疑叛国而于1629年逃到艾哈迈德讷格尔王国的将军。沙贾汗在布尔汉布尔指挥军事行动。
1657年，沙贾汗病重，他的四个儿子开始争夺皇位。
沙贾汗宠爱他的长子达拉·什克（Dara Shikoh），但他的第三子奥朗则布在诸王子中最有能力，他和达拉·什克特别仇视对方。
沙贾汗恢复了健康，但那时他的儿子们之间的冲突已经到了没有回头路的地步，因此他无法阻止家族内部的战争。
1658年，奥朗则布获胜，废黜了他的父亲。
17世纪中期，莫卧儿帝国处在黄金时代。
印度人本是杰出的建筑师，皇帝沙贾汗时期，印度建成了德里的红堡等许多著名建筑。在这众多的名胜古迹中，最著名的是沙贾汗为其死去的宠妃建造的礼物——阿格拉市的泰姬陵。
奥朗则布是莫卧儿帝国最重要但也最具争议的皇帝。
他放弃了莫卧儿帝国初期尤其是阿克巴时代的宗教宽容政策，加强伊斯兰教的宗教地位，企图使印度完全伊斯兰化。
奥朗则布恢复对非穆斯林征收人头税，将印度教徒逐出政府，并大举拆毁印度教庙宇与神像。
这些短视的政策导致帝国境内的非穆斯林与政府的矛盾突然尖锐起来，并很快演变成武装斗争。
坚持自己信仰的锡克教徒和拉其普特人成为莫卧儿帝国公开的敌人；奥朗则布虽然多次打败他们，却无法彻底消灭其反抗力量。
最危险的国内敌人是新兴的马拉塔人国家，它后来发展出可与莫卧儿帝国匹敌的军事能力。
另一方面，由于奥朗则布力图消灭他的政治对手，莫卧儿帝国的疆域在他在位时扩张到最大限度。
他长期驻留在德干指挥对该地区各穆斯林小国的征服，这些国家是16世纪初德干的伊斯兰教强国巴赫马尼王朝分裂后形成的。
其结果是奥朗则布取得了胜利，将德干地区并入帝国版图，成为印度南方的最高统治者。
除了南亚次大陆的南端和马拉塔王国以外，奥朗则布统一了整个印度次大陆。奥朗则布去世后的莫卧儿帝国称为“后期莫卧儿”。
这一时期的特点是，皇帝大都昏庸无能，马拉塔人愈战愈强，大有取莫卧儿而代之的趋势。但是，决定印度命运的因素是新生的欧洲列强。
帝国衰落
18世纪初，到奥朗则布去世时，留下的已是一个四分五裂的帝国。
当时，欧洲殖民者，特别是英国殖民者正加紧侵略印度，而印度已陷于分裂，削弱了抵抗力量。
旁遮普农民用自己的锡克教作为思想武器和组织形式，要求消灭种姓区别，提出建立土地归农民所有的“真理王国”。
他们发动了坚持数十年的农民武装斗争，斗争此起彼伏，规模愈来愈大，起义地区实际上一度摆脱了莫卧儿帝国的管辖。
但由于各自为战，后来被国家统治者各个击败。同时，莫卧儿帝国统治也开始衰落了。
衰落了的国家机关无力抵御来自西北方的外族入侵。1748年，阿富汗人侵入莫卧儿北部，几度进占德里。
1761年，阿富汗游牧军与马拉塔人10万大军在巴尼帕特会战，马拉塔人又遭惨败。
马拉塔人是莫卧儿一支抵抗西方侵略者的强大力量，但经过这次会战，受到严重削弱。
这时与英国争夺莫卧儿的劲敌是法国，经过1756—1763年的英法“七年战争”，英国驱逐了法国的势力。
在“七年战争”期间，英国殖民者首先向富庶的孟加拉省下手。
1757年1月，英国派遣臭名昭著的殖民强盗克莱武率领侵略军在孟加拉省登陆，收买孟加拉省总督属下的内奸，打败孟加拉军，实行野蛮统治。
最后使得他所立的傀儡米尔·卡西姆也不能容忍他的控制，迁都备战，率兵两万，于1763年发动反英起义。
1774年，占领孟加拉后，英国殖民者立即把孟加拉西北的奥德邦收为附庸，并转而南侵迈索尔邦，逐步实施征服整个次大陆的狂妄计划。
但迈索尔邦的苏丹海达尔·阿里和他的儿子铁普苏丹（1782—1799年在位）领导人民英勇抗击英军。
铁普苏丹于1799年5月，在保卫首府战役中英勇牺牲。
从19世纪40年代起，英国侵略的矛头转向北面锡克教人居住的旁遮普地区（今巴基斯坦境内）。锡克教徒英勇抵抗，但是封建主怕发动群众，加上指挥不当，没有团结伊斯兰教和印度教徒共同对敌，以致旁遮普为英国所侵占。
当时次大陆上已经没有权威的国家组织，莫卧儿帝国已徒有虚名，宗教、民族、种姓、地区等种种对立，使英国侵略者能够利用来各个击破，分而治之。
英国在1849年吞并旁遮普以后，莫卧儿帝国完全沦为英国殖民地，对莫卧儿在政治上继续采用“分而治之”的手段进行统治，政府实权在英国人手里，莫卧儿皇帝只是一个傀儡而已。
1857年5月，为了反对英国殖民者，莫卧儿民族反英起义爆发。起义者拥立早已名存实亡的莫卧儿帝国末代皇帝巴哈杜尔·沙二世为印度皇帝，
在章西邦，章西女王（1835—1858年）是反英起义中的重要领袖。
她是章西邦王后，夫死后，国土被东印度公司吞并，受英国直接统治，剥削加重。
1857年，章西女王亲自率领本邦军民起义，驱逐英军，占领章西，重新复国。
次年初，章西成为中印度起义中心，女王亲自指挥章西军民与英军激战八天，重创英军。
后率军向西转移，与英军决战中身先士卒，奋勇杀敌，最后英勇牺牲，死时年仅23岁。
莫卧儿帝国完全被英国殖民者占领。但莫卧儿民族反英起义也沉重打击了英国殖民统治，“使英国的统治从印度的一端到另一端发生动摇”。
之后，莫卧儿帝国末代皇帝巴哈杜尔被英国殖民当局放逐。
灭亡之后
莫卧儿帝国消亡后，英国又直接统治印度共90年，至1947年。
当莫卧儿人摆脱英国统治的时候，已变成印度、巴基斯坦、孟加拉、阿富汗、伊朗等诸国，早年从中亚迁来的伊斯兰教蒙古人早已与这些国家的各民族融合为一体。