转基因作物衍生的转基因食品的外源基因多种多样，就相对全面的总结一下吧:
一、抗除草剂转基因作物(大豆，玉米等)转入的是两类基因，一类是抗草甘膦的EPSPS，基因来源于各种植物或者微生物；第二类是抗草铵膦的PAT和bar。
二、抗虫类的转基因作物(玉米，水稻等)，转入的是来自用于有机农业中的生物杀菌剂中的活性成分苏云金芽孢杆菌的Bt蛋白基因。也有其它的改造的基因。
三、黄金大米，转入的主要是玉米来源的psy1和细菌来源的crtI，还有其他一些类似的基因。
四、植酸酶玉米，转入的是黑曲霉的植酸酶基因AO
五、紫晶大米，转入玉米来源的PI,Lc,以及彩叶草的六个基因见图中Ss打头的红色英文。
六、增加各种维生素的以及锌铁铜含量的转基因玉米水稻小麦大麦见下图。图中的gene一列就是各种基因的名称不一一赘述了